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附件 食管鳞癌的基因组变异谱研究 宋咏梅，詹启敏 （中国医学科学院&北京协和医学院 肿瘤医院 分子肿瘤学国家重点实验室，100021，北京） 目的：通过基因组测序、aCGH 和功能生物学研究揭示食管鳞癌的基因组变异特征。 方法：17 例食管鳞癌进行全基因组测序、71 例进行外显子组测序、123 例进行 aCGH 检测，通过分析 SNV、CNV、indel、SV 数据，综合研究了食管鳞状细胞癌基因组数据概 况、突变频谱、重要突变基因、组蛋白修饰相关基因突变、拷贝数变异、结构变异、重 要通路变异以及药物靶基因变异，并且通过构建的野生型与突变型质粒，研究了突变基 因、扩增区域 microRNA 的生物学功能。 结果：研究发现了 8 个与食管鳞癌发生相关的重要的基因突变，其中 FAM135B 是首 次发现的肿瘤相关基因；获得了食管鳞癌拷贝数变异的重要数据，发现位于染色体 11q13.3-13.4 扩增区域的 MIR548K 参与食管鳞癌的恶性表型的形成，这些基因的变异是 食管癌发生发展的重要因素，与食管癌的预后密切相关；发现重要组蛋白调节基因 MLL2、ASH1L、MLL3、SETD1B 和 CREBBP/EP300 在食管鳞癌中呈现频繁非沉默突变；对 潜在治疗靶点进行分析，发现 PI3K 是食管鳞癌突变频率最高的潜在药靶，并发现 PSMD2、 RARRES1、 SRC、GSK3β和 SGK3 等潜在新药靶。整合了所有基因突变和基因拷 贝变异数据，确定了与食管鳞癌发生发展相关的重要信号通路，包括 Wnt、cell cycle、 Notch、RTK-Ras 和 AKT 通路。 结论：全面揭示了食管鳞癌的基因组变异特征，这些发现能够确定新的突变和扩增 基因， 研发临床分子标志物和潜在药靶，FAM135B、microRNA548K 未来可能作为食管鳞 状细胞癌诊断的标记物或者治疗的靶点。 关键词：食管鳞癌 基因组 变异谱 1